W związku z trwającą epidemią pojawiło się sporo wątpliwości dotyczących postępowania z odpadami. W celu ujednolicenia w praktyce postępowania w tym obszarze minister klimatu oraz Główny Inspektor Sanitarny wydali dokument pn.: Wytyczne w sprawie postępowania z odpadami wytwarzanymi w czasie występowania zakażeń koronawirusem SARS-CoV-2 i zachorowań na wywoływaną przez niego chorobę COVID-19 (w czasie trwania pandemii/epidemii).