Kontrolą osób fizycznych prowadzących gospodarstwa rolne w ilości poniżej 40.000 stanowisk dla drobiu, 2.000 stanowisk dla świń o wadze powyżej 30 kg oraz 750 stanowisk dla macior zajmują się wójt, burmistrz lub prezydent miasta w ramach swoich uprawnień. W przypadku gospodarstw powyżej wskazanych ilości, czyli tzw. wielkoprzemysłowych ferm zwierząt, sprawowaniem kontroli nad przestrzeganiem wymogów ochrony środowiska zajmuje się wojewódzki inspektor ochrony środowiska (WIOŚ).