Dokumentami strategicznymi mającymi zagwarantować odpowiednią ochronę gatunków i siedlisk są:

- plany zadań ochrony obszaru 2000 (PZO N2000), które mają uproszczoną strukturę i są mniej restrykcyjne z punktu widzenia podmiotów zainteresowanych prowadzeniem niektórych rodzajów działalności na tych terenach,

- plany ochrony obszarów Natura 2000 (PO N2000) – bardziej szczegółowe, opracowywane dla terenów, na których należy wdrożyć zaawansowane, specyficzne zadania ochronne.